Em 1994 foi instalado o Laboratório de Águas Residuais da ETAR da Quinta da Bomba, que iniciou a sua actividade no controlo da eficiência da primeira ETAR construída pelo Município de Almada, tendo realizado nesse ano 435 análises a 6 parâmetros físico-químicos.

Nos anos seguintes a sua actividade cresceu, quer em número de análises, quer em parâmetros e métodos de ensaio disponíveis, tendo sido apetrechado gradualmente com novos equipamentos.

No ano 2003, estando em construção a ETAR do Portinho da Costa e concluída a construção da ETAR da Mutela, o Laboratório Central foi deslocalizado para a ETAR da Mutela, onde conta hoje com uma equipa de 5 profissionais que efectuam todo o controlo de processo e auto-controlo da rejeição final de efluentes das várias ETARs do Município, através da realização anual de mais de 9000 análises a parâmetros físico-químicos, microbiológicos e microscopia.

As unidades laboratoriais da ETAR da Quinta da Bomba e da ETAR do Portinho da Costa desenvolvem, apenas pontualmente, ensaios de apoio aos processos de tratamento das respectivas ETAR.

Para assegurar a conformidade dos resultados é efectuado um rigoroso controlo de qualidade, de acordo com as normas em vigor. O LABAR participa anualmente em vários Ensaios Interlaboratoriais, avaliando o seu desempenho em comparação com outros laboratórios nacionais e estrangeiros. Com vista à sua acreditação futura o LABAR desenvolve a sua actividade segundo a norma NP EN ISO 17 025:2005, respeitante aos Requisitos gerais de competência para laboratórios de ensaio e calibração.